లుయిగి రికియార్డి 1 , రోసా మజ్జియో 2,*©, ఏంజెలో రాffaele Marcotrigiano 1 , గుగ్లీల్మో రైనాల్డి 3 , పాలో ఐయోవినో 4 , వీటో జోన్నో 1 , స్టెఫానో పవన్ 1© మరియు కాన్సెట్టా లొట్టి 2,*
- 1 డిపార్ట్మెంట్ ఆఫ్ సాయిల్, ప్లాంట్ అండ్ ఫుడ్ సైన్సెస్, ప్లాంట్ జెనెటిక్స్ అండ్ బ్రీడింగ్ యూనిట్ యూనివర్శిటీ ఆఫ్ బారీ, వయా అమెండోలా 165/A, 70125 బారీ, ఇటలీ; luigi.ricciardi@uniba.it (LR);angelo.marcotrigiano@uniba.it (ARM); vito.zonno@uniba.it (VZ); stefano.pavan@uniba.it (SP)
- 2 డిపార్ట్మెంట్ ఆఫ్ సైన్సెస్ ఆఫ్ అగ్రికల్చర్, ఫుడ్ అండ్ ఎన్విరాన్మెంట్, యూనివర్శిటీ ఆఫ్ ఫోగ్గియా, వయా నాపోలి 25, 71122 ఫోగ్గియా, ఇటలీ
- 3 డిపార్ట్మెంట్ ఆఫ్ బయోసైన్సెస్, బయోటెక్నాలజీస్ అండ్ బయోఫార్మాస్యూటికల్స్, యూనివర్శిటీ ఆఫ్ బారీ, వయా ఒరాబోనా 4, 70125 బారీ, ఇటలీ; guglielmo.rainaldi@uniba.it
- 4 డిపార్ట్మెంట్ ఆఫ్ ఎనర్జీ టెక్నాలజీస్, బయోఎనర్జీ, బయోఫైనరీ మరియు గ్రీన్ కెమిస్ట్రీ డివిజన్, ENEA ట్రిసయా రీసెర్చ్ సెంటర్, SS 106 అయోనికా, కిమీ 419+500, 75026 రోటోండెల్లా (MT), ఇటలీ; paolo.iovieno@enea.it
* ఉత్తర ప్రత్యుత్తరాలు: rosa.mazzeo@unifg.it (RM); concetta.lotti@unifg.it (CL)
నైరూప్య:
ఉల్లిపాయ (అల్లియం సెపా L.) ప్రపంచవ్యాప్తంగా రెండవ అత్యంత ముఖ్యమైన కూరగాయల పంట మరియు దాని ఆరోగ్య ప్రయోజనాల కోసం విస్తృతంగా ప్రశంసించబడింది. దాని ముఖ్యమైన ఆర్థిక ప్రాముఖ్యత మరియు క్రియాత్మక ఆహారంగా దాని విలువ ఉన్నప్పటికీ, ఉల్లిపాయ దాని జన్యు వైవిధ్యానికి సంబంధించి పేలవంగా పరిశోధించబడింది. ఇక్కడ, మేము బరి (అపులియా, ఇటలీ యొక్క దక్షిణం) ప్రావిన్స్లోని ఒక చిన్న పట్టణంలో శతాబ్దాల నాటి సాగు చరిత్ర కలిగిన ల్యాండ్రేస్ అయిన “ఆక్వావివా రెడ్ ఆనియన్” (ARO)లో జన్యు వైవిధ్యాన్ని సర్వే చేసాము. 11 ARO జనాభా మరియు మూడు సాధారణ వాణిజ్య రకాలను కలిగి ఉన్న జెర్మ్ప్లాజమ్ సేకరణలో జన్యు వైవిధ్యాన్ని అన్వేషించడానికి 13 మైక్రోసాటిలైట్ గుర్తుల సమితి ఉపయోగించబడింది. పారామెట్రిక్ మరియు నాన్-పారామెట్రిక్ పద్ధతులతో జన్యు నిర్మాణం యొక్క విశ్లేషణలు ARO బాగా నిర్వచించబడిన జన్యు సమూహాన్ని సూచిస్తుందని హైలైట్ చేసింది, ఇది తరచుగా తప్పుగా భావించే ట్రోపియా మరియు మోంటోరో ల్యాండ్రేస్ల నుండి స్పష్టంగా భిన్నంగా ఉంటుంది. సాధారణంగా తాజా వినియోగం కోసం ఉపయోగించే బల్బుల వివరణను అందించడానికి, పైన పేర్కొన్న రెండు ల్యాండ్రేస్లకు సంబంధించి AROలో అధిక తీపిని చూపిస్తూ, కరిగే ఘన కంటెంట్ మరియు ఘాటు మూల్యాంకనం చేయబడ్డాయి. మొత్తంమీద, ప్రస్తుత అధ్యయనం ARO యొక్క భవిష్యత్తు విలువీకరణకు ఉపయోగపడుతుంది, ఇది వాణిజ్యపరమైన మోసాలను పరిమితం చేయడానికి మరియు చిన్న హోల్డర్ల ఆదాయాన్ని మెరుగుపరచడానికి దోహదపడే నాణ్యమైన లేబుల్ల ద్వారా ప్రచారం చేయబడవచ్చు.
పరిచయం
అల్లియం జాతిలో దాదాపు 750 జాతులు ఉన్నాయి [1], వీటిలో ఉల్లిపాయ (అల్లియం సెపా L., 2n = 2x =16) అత్యంత విస్తృతంగా వ్యాపించిన వాటిలో ఒకటి. A. సెపా ద్వివార్షిక చక్రాన్ని కలిగి ఉంటుంది మరియు పునరుత్పత్తి ప్రవర్తనను అధిగమించింది. ఈ రోజుల్లో, ఉల్లిపాయల గ్లోబల్ ఉత్పత్తి (97.9 Mt) టమోటా తర్వాత రెండవ అత్యంత ముఖ్యమైన కూరగాయల పంటగా చేస్తుంది [2]. పురాతన కాలం నుండి, ఉల్లిపాయ గడ్డలు ఆహారంగా మరియు జానపద ఔషధ అనువర్తనాల్లో ఉపయోగించబడుతున్నాయి. నిజానికి, పురాతన ఈజిప్షియన్లు 1550 BC నాటి మెడికల్ పాపిరస్, కోడెక్స్ ఎబర్స్ [3]లో వెల్లుల్లి మరియు ఉల్లిపాయల వాడకం ఆధారంగా అనేక చికిత్సా సూత్రాలను ఇప్పటికే నివేదించారు.
ఈ బహుముఖ మరియు ఆరోగ్యకరమైన కూరగాయలను పచ్చిగా, తాజాగా లేదా ప్రాసెస్ చేసిన ఉత్పత్తిగా తీసుకుంటారు మరియు అనేక వంటకాల రుచిని మెరుగుపరచడానికి ఉపయోగిస్తారు. ఉల్లిపాయల వినియోగం హృదయ సంబంధ వ్యాధులు [4,5], ఊబకాయం [6], మధుమేహం [7] మరియు వివిధ రకాల క్యాన్సర్ [8-10] ప్రమాదాన్ని తగ్గిస్తుందని అనేక ఇటీవలి అధ్యయనాలు పేర్కొన్నాయి. ఉల్లిపాయ ఆరోగ్య హక్కులు తరచుగా రెండు తరగతుల న్యూట్రాస్యూటికల్ సమ్మేళనాల యొక్క అధిక స్థాయిలకు ఆపాదించబడతాయి: ఫ్లేవనాయిడ్లు మరియు ఆల్క్(ఎన్)యల్ సిస్టీన్ సల్ఫాక్సైడ్లు (ACSOs). మొదటి తరగతిలో ఫ్లేవనోల్స్ మరియు ఆంథోసైనిన్లు ఉంటాయి. ఫ్రీ రాడికల్ స్కావెంజింగ్ మరియు ట్రాన్సిషన్ మెటల్ అయాన్ బైండింగ్లో బలమైన యాంటీఆక్సిడెంట్ మరియు యాంటీ ఇన్ఫ్లమేటరీ లక్షణాలకు పేరుగాంచిన క్వెర్సెటిన్ ప్రధాన గుర్తించదగిన ఫ్లేవనాల్. [11]; అయితే ఆంథోసైనిన్లు కొన్ని ఉల్లిపాయ రకాలకు ఎరుపు/ఊదా రంగును అందిస్తాయి. ACSOల విషయానికొస్తే, అత్యంత సమృద్ధిగా ఐసోఅల్లిన్ [(+)-ట్రాన్స్-S-1-ప్రొపెనిల్-ఎల్-సిస్టైన్ సల్ఫాక్సైడ్] [12], అస్థిర మరియు నాన్-ప్రోటీనోజెనిక్ సల్ఫర్ అమైనో ఆమ్లం కణాలలో నిల్వ చేయబడుతుంది, ఇది ఉల్లిపాయల వాసన మరియు రుచికి పరోక్షంగా కారణమవుతుంది [13]. కణజాలం అంతరాయం ఏర్పడినప్పుడు, ఐసోఅల్లిన్ అలియినేస్ అనే ఎంజైమ్ ద్వారా విడదీయబడి అస్థిర సమ్మేళనాల శ్రేణిని (పైరువేట్, అమ్మోనియా, థియోసల్ఫోనేట్స్ మరియు ప్రొపనేథియల్ S-ఆక్సైడ్) ఉత్పత్తి చేస్తుంది, ఇది చిరిగిపోవడాన్ని ప్రేరేపిస్తుంది మరియు అసహ్యకరమైన వాసన (తీవ్రత) కలిగిస్తుంది. [14]. ఉల్లి తీక్షణతను తరచుగా ఒక గ్రాము తాజా బరువులో, జలవిశ్లేషణ ద్వారా ఉత్పత్తి చేయబడిన పైరువిక్ యాసిడ్ మొత్తంగా కొలుస్తారు. [15,16].
మధ్యధరా బేసిన్ దేశాలలో, ద్వితీయ వైవిధ్య కేంద్రాలలో ఒకటిగా ప్రతిపాదించబడింది ఎ. సెపా [17,18], ఉల్లిపాయ గడ్డలు ఆకారం, పరిమాణం, రంగు, పొడి పదార్థం మరియు తీక్షణతలో విస్తృత వైవిధ్యాన్ని ప్రదర్శిస్తాయి [19-22]. అంతేకాకుండా, సల్ఫర్-ఆధారిత ఫలదీకరణం, వ్యవసాయ పద్ధతులు, నేల రకం, వాతావరణ పరిస్థితులు మరియు సాగులు లేదా ల్యాండ్రేస్ల జన్యురూపం విచిత్రమైన ఆర్గానోలెప్టిక్ మరియు పోషక విలువలను అందించడం ద్వారా బల్బ్ నాణ్యతను ప్రభావితం చేస్తాయి. [23-27]. ఇటలీలో, విస్తృత ఉల్లిపాయ జెర్మ్ప్లాజం అందుబాటులో ఉన్నప్పటికీ, కొన్ని ఉల్లిపాయ రకాలు మాత్రమే తరచుగా శాస్త్రీయ అధ్యయనాలకు లోబడి ఉంటాయి మరియు సరిగ్గా వర్గీకరించబడతాయి. [28,29].
మొక్కల జన్యు వనరుల సముచిత పరిరక్షణకు హామీ ఇవ్వడానికి మరియు విలువ గొలుసులో నిర్దిష్ట జన్యురూపాల వినియోగాన్ని ప్రోత్సహించడానికి వ్యవసాయ-జీవవైవిధ్యం యొక్క సంపూర్ణ జన్యు మరియు సమలక్షణ లక్షణాలు చాలా ముఖ్యమైనవి. [30-32]. మ్యాపింగ్ కోసం సింపుల్ సీక్వెన్స్ రిపీట్ (SSR) గుర్తులను తరచుగా ఎంపిక చేస్తారు [33-35], DNA వేలిముద్ర మరియు సాగు వివక్ష [36-38], మరియు ల్యాండ్రేస్లలో మరియు వాటి మధ్య జన్యు వైవిధ్యం యొక్క నమ్మకమైన అంచనా [39-42], అవి లోకస్ స్పెసిఫిక్, మల్టీ-అల్లెలిక్, కోడొమినెంట్గా వారసత్వంగా వచ్చినవి, అధిక పునరుత్పత్తి మరియు ఆటోమేటెడ్ జెనోటైపింగ్కు తగినవి కాబట్టి.
ప్రస్తుత అధ్యయనంలో, బారీ ప్రావిన్స్లోని అక్వావివా డెల్లె ఫోంటి పట్టణంలోని ఒక చిన్న ప్రాంతంలో సేంద్రీయ వ్యవసాయ పద్ధతుల ప్రకారం సాగు చేయబడిన అపులియన్ సాంప్రదాయ ల్యాండ్రేస్, “అక్వావివా రెడ్ ఆనియన్” (ARO) పై మేము మా దృష్టిని కేంద్రీకరించాము. (అపులియా, దక్షిణ ఇటలీ). ఈ ల్యాండ్రేస్ యొక్క బల్బులు పెద్దవి మరియు చదునుగా మరియు ఎరుపు రంగులో ఉంటాయి మరియు స్థానిక వంటకాల్లో ఎక్కువగా ఉపయోగించబడతాయి. ARO "స్లో ఫుడ్ ప్రెసిడియం" నాణ్యత గుర్తును పొందినప్పటికీ, దాని ఉత్పత్తిని యూరోపియన్ యూనియన్ నాణ్యతా గుర్తులైన రక్షిత భౌగోళిక సూచిక (PGI) మరియు రక్షిత హోదా (POD) వంటి వాటి ద్వారా మరింత ప్రోత్సహించవచ్చు మరియు రక్షించబడుతుంది, ఎందుకంటే ఇవి పరిమితం చేయడానికి దోహదం చేస్తాయి. వాణిజ్య మోసాలు మరియు చిన్న హోల్డర్ల ఆదాయాన్ని మెరుగుపరుస్తాయి. ఇక్కడ, ARO జనాభాలో జన్యు వైవిధ్యాన్ని అంచనా వేయడానికి మరియు ఇతర రెండు దక్షిణ ఇటాలియన్ రెడ్ ఆనియన్ ల్యాండ్రేస్ల నుండి ఈ ల్యాండ్రేస్ను వివరించడానికి SSR మాలిక్యులర్ మార్కర్లు శక్తివంతమైన సాధనాలుగా ఉపయోగించబడ్డాయి. ఇంకా, మార్కెట్ డిమాండ్కు సంబంధించి ARO ఫ్లేవర్ని అంచనా వేయడానికి మేము చురుకుదనం మరియు కరిగే ఘన కంటెంట్ను అంచనా వేసాము.
ఫలితాలు
అక్వావివా రెడ్ ఆనియన్ జెర్మ్ప్లాజమ్ సేకరణ మరియు పదనిర్మాణ లక్షణాన్ని ఏర్పాటు చేయడం
ARO ల్యాండ్రేస్లోని 13 జనాభా విత్తనాలను, బయోడైవర్ఎస్ఓ అపులియా రీజియన్ ప్రాజెక్ట్ ఫ్రేమ్వర్క్లో రైతులు విరాళంగా అందించారు, ARO జెర్మ్ప్లాజమ్ సేకరణను స్థాపించడానికి ఉపయోగించారు.
బల్బ్, చర్మం మరియు మాంసానికి సంబంధించిన పదనిర్మాణ వివరణలు ARO జెర్మ్ప్లాజంపై మరియు మూడు ఉల్లిపాయ ల్యాండ్రేస్లపై సేకరించబడ్డాయి, రెండు “ట్రోపియా రెడ్ ఆనియన్” (TRO) ల్యాండ్రేస్కు చెందినవి మరియు ఒకటి “మోంటోరో కాపర్ ఆనియన్” (MCO) ల్యాండ్రేస్ (మూర్తి 1). అన్ని ARO బల్బులు ఫ్లాట్గా ఉన్నాయి మరియు ఎరుపు రంగులో ఉండే వివిధ షేడ్స్తో ఎరుపు బాహ్య చర్మం మరియు మాంసాన్ని కలిగి ఉంటాయి. దీనికి విరుద్ధంగా, TRO బల్బుల మాంసం పూర్తిగా ఎరుపు రంగులో ఉంది, అయితే MCO బల్బుల మాంసం పేలవంగా వర్ణద్రవ్యం (టేబుల్ S1). బయోకెమికల్ విశ్లేషణ ఘన కరిగే కంటెంట్ మరియు తీక్షణతను అంచనా వేయడానికి అనుమతించబడింది. పట్టికలో నివేదించినట్లు 1, ARO జనాభాలో బల్బుల యొక్క ఘన కరిగే కంటెంట్ యొక్క సగటు విలువలు 7.60 మరియు 6.00 (ARO12) నుండి 9.50° Brix (ARO11 మరియు ARO13) వరకు ఉన్నాయి. ఈ విలువ TRO మరియు MCO ల్యాండ్రేస్లకు (వరుసగా 4.25 మరియు 6.00° బ్రిక్స్) అంచనా వేసిన దాని కంటే ఎక్కువగా ఉంది.
పట్టిక 11. “అక్వావివా రెడ్ ఆనియన్” (ARO), “ట్రోపియా రెడ్ ఆనియన్” (TRO), మరియు “మోంటోరో కాపర్ ఆనియన్” (MCO) జనాభాలో సాలిడ్ సోలబుల్ కంటెంట్ మరియు ఘాటైన విలువలు అంచనా వేయబడ్డాయి *.
CODE | కరిగే ఘన కంటెంట్ (బ్రిక్స్) | తీక్షణత (pmolg-1 FW) | ||
మీన్ | CV y (%) | మీన్ | CV y (%) | |
ARO1 | 6.25 D * | 5.65 | 5.84 అబ్ * | 23.78 |
ARO2 | 7.25 DC | 4.87 | ఒక | 22.98 |
ARO3 | 7.50 BCD | 9.42 | 5.28 అబ్ | 22.88 |
ARO4 | 7.50 BCD | 0.00 | ఒక | 3.74 |
ARO 5 | 7.50 BCD | 0.00 | ఒక | 9.68 |
ARO6 | X DX | 5.65 | 4.51 అబ్ | 39.18 |
ARO7 | 7.25 DC | 4.87 | 5.25 అబ్ | 15.44 |
ARO8 | 9.00 AB | 0.00 | ఒక | 3.49 |
ARO9 | 8.25 ABC | 4.28 | ఒక | 0.15 |
ARO10 | 7.00 DC | 0.00 | 5.94 అబ్ | 6.57 |
ARO11 | 9.50 ఒక | 7.44 | 5.54 అబ్ | 16.43 |
ARO12 | X DX | 0.00 | 4.91 అబ్ | 9.70 |
ARO13 | 9.50 ఒక | 7.44 | ఒక | 24.93 |
MCO | X DX | 0.00 | 4.18 అబ్ | 2.66 |
TRO1 | 4.25 E | 8.31 | 2.80 b | 2.10 |
TRO2 | 4.25 E | 8.31 | 4.28 అబ్ | 4.79 |
* పెద్ద అక్షరం లేదా చిన్న అక్షరాలతో ఒకే అక్షరాలతో అంటే వరుసగా 0.01P లేదా 0.05P (SNK యొక్క పరీక్ష) వద్ద గణాంకపరంగా భిన్నంగా ఉండదు. y భేద గుణకం.
పైరువిక్ యాసిడ్ కంటెంట్ ద్వారా అంచనా వేయబడిన ARO చురుకుదనం యొక్క సగటు విలువ 6.00, ఇది 4.51 pmol g నుండి ఉంటుంది.-1 FW (ARO6) నుండి 7.04 (ARO8). ఈ విలువ TRO మరియు MCO ల్యాండ్రేస్లలో అంచనా వేసిన దాని కంటే ఎక్కువగా ఉంది (3.54 pmol g-1 FW మరియు 4.18 pmol g-1 FW, వరుసగా).
SSR పాలిమార్ఫిజం మరియు ప్రవేశాల మధ్య జన్యు సంబంధాలు
ప్రస్తుత అధ్యయనంలో, పరీక్షించిన 11 SSR ప్రైమర్ కాంబినేషన్లలో 37 సింగిల్-లోకస్ పాలిమార్ఫిజమ్లను అందించాయి, అనగా, ఒకే వ్యక్తిలో గరిష్టంగా రెండు యాంప్లిఫికేషన్ ఉత్పత్తులను అందిస్తాయి. మొత్తంమీద, 55 (ACM320 మరియు ACM 2) నుండి 147 (ACM504) వరకు మరియు సగటు విలువ 11 యుగ్మ వికల్పాలు (టేబుల్) 132 మంది వ్యక్తులలో 5 యుగ్మ వికల్పాలు కనుగొనబడ్డాయి. 2). వ్యక్తిగత జనాభాలో, యుగ్మ వికల్పాల సంఖ్య (Na) 1.94 (ACM147 మరియు ACM504) నుండి 5.38 (ACM132) వరకు ఉంటుంది, అయితే యుగ్మ వికల్పాల (Ne) ప్రభావవంతమైన సంఖ్య 1.41 (ACM152) నుండి 2.82 (ACM449) వరకు ఉంటుంది. వ్యత్యాసాలు Na మరియు Ne మధ్య విలువలు జనాభాలో తక్కువ పౌనఃపున్యం కలిగిన యుగ్మ వికల్పాల ఉనికి మరియు కొన్ని యుగ్మ వికల్పాల ప్రాబల్యం కారణంగా ఉన్నాయి. అత్యధికంగా గమనించిన హెటెరోజైగోసిటీ (Ho) విలువ ACM138 మరియు ACM449 (0.62) కోసం హైలైట్ చేయబడింది, అయితే అత్యల్పమైనది ACM152 (0.25)తో అనుబంధించబడింది. పాన్మిక్టిక్ పాపులేషన్లో సైద్ధాంతిక అంచనాకు అనుగుణంగా ఉండే ఎక్స్పెక్టెడ్ హెటెరోజైగోసిటీ (అతను), 0.37 (ACM504) నుండి 0.61 (ACM132, ACM138 మరియు ACM449) వరకు ఉంటుంది. రైట్ యొక్క స్థిరీకరణ సూచిక (Fis), అన్ని మార్కర్ల కోసం సున్నా (సగటు 0.05)కి దగ్గరగా ఉన్న విలువలను ప్రదర్శించింది, ఇది గమనించిన మరియు ఊహించిన హెటెరోజైగోసిటీ స్థాయిల మధ్య సారూప్య విలువలను సూచిస్తుంది, ఇది దాటిన జాతికి ఊహించిన విధంగా ఉంటుంది. జన్యు వేలిముద్రలో వ్యక్తిగత SSR మార్కర్ యొక్క సామర్థ్యం పాలిమార్ఫిక్ ఇన్ఫర్మేషన్ కంటెంట్ (PIC) సూచిక ద్వారా అంచనా వేయబడింది, సగటు విలువ 0.48 మరియు 0.33 (ACM504) నుండి 0.67 (ACM132) వరకు ఉంటుంది. మరొక సమర్థత సూచిక, షానన్ యొక్క సమాచార సూచిక (I) సగటు విలువ 0.84ను ప్రదర్శిస్తుంది మరియు అంచనా విలువలు 0.45 (ACM152) నుండి 1.20 (ACM132) వరకు ఉంటాయి.
పట్టిక 11. ARO, TRO మరియు MCO జనాభాలో జన్యు వైవిధ్యాన్ని అంచనా వేయడానికి ఉపయోగించే 11 SSR మార్కర్ల పాలిమార్ఫిజం లక్షణాలు. యుగ్మ వికల్పాల మొత్తం సంఖ్య (Na), బ్యాండ్ సైజు పరిధి మరియు పాలిమార్ఫిక్ సమాచార కంటెంట్ (PIC) సూచిక ఈ అధ్యయనంలో జన్యురూపం పొందిన మొత్తం 320 వ్యక్తుల సెట్ను సూచిస్తుంది. యుగ్మ వికల్పాల సంఖ్య (Na), ప్రభావవంతమైన యుగ్మ వికల్పాల సంఖ్య (Ne), గమనించిన హెటెరోజైగోసిటీ (Ho), ఆశించిన హెటెరోజైగోసిటీ (He), ఫిక్సేషన్ ఇండెక్స్ (Fis), మరియు షానన్ యొక్క సమాచార సూచిక (I) 16 జనాభా నుండి లెక్కించబడిన సగటు విలువలను సూచిస్తుంది, ఒక్కొక్కటి 20 మంది వ్యక్తులచే రూపొందించబడింది.
లోకస్. | మొత్తం Na | పరిమాణ పరిధి (bp) | PIC | మీన్ | |||||
Na | Ne | Ho | He | I | Fis | ||||
ACM91 | 4 | 189-205 | 0.40 | 2.63 | 1.72 | 0.38 | 0.39 | 0.66 | 0.04 |
ACM101 | 4 | 229-241 | 0.52 | 2.94 | 2.37 | 0.53 | 0.56 | 0.92 | 0.06 |
ACM132 | 11 | 186-248 | 0.67 | 5.38 | 2.78 | 0.55 | 0.61 | 1.20 | 0.09 |
ACM138 | 5 | 242-272 | 0.66 | 3.69 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.09 | -0.02 |
ACM147 | 2 | 264-266 | 0.37 | 1.94 | 1.83 | 0.44 | 0.44 | 0.62 | -0.01 |
ACM152 | 4 | 228-244 | 0.25 | 2.38 | 1.41 | 0.25 | 0.27 | 0.45 | 0.07 |
ACM235 | 4 | 286-298 | 0.41 | 2.81 | 1.77 | 0.44 | 0.41 | 0.72 | -0.06 |
ACM446 | 6 | 108-120 | 0.56 | 3.50 | 2.48 | 0.49 | 0.58 | 1.01 | 0.16 |
ACM449 | 8 | 120-140 | 0.66 | 4.88 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.18 | -0.03 |
ACM463 | 5 | 202-210 | 0.47 | 3.38 | 1.95 | 0.46 | 0.48 | 0.83 | 0.05 |
ACM504 | 2 | 188-192 | 0.33 | 1.94 | 1.64 | 0.30 | 0.37 | 0.54 | 0.20 |
మీన్ | 5 | 0.48 | 3.22 | 2.15 | 0.46 | 0.48 | 0.84 | 0.05 |
జనాభాలో, ARO3, ARO6, ARO8, ARO10, TRO1 మరియు MCO అధిక స్థాయి జన్యు వైవిధ్యాన్ని ప్రదర్శించాయి (Ho > 0.5), అయితే ARO7 (Ho = 0.27) (సప్లిమెంటరీ టేబుల్ S2) జనాభాలో అత్యల్ప వైవిధ్యం గమనించబడింది. మొత్తంగా, అన్ని ప్రవేశాలు F ప్రదర్శించబడతాయిis సున్నాకి దగ్గరగా ఉన్న విలువలు (Fis యాదృచ్ఛిక సంభోగం పరిస్థితులలో ఊహించినట్లుగా సగటు విలువ = 0.054.
మాలిక్యులర్ వేరియెన్స్ మరియు జెనెటిక్ స్ట్రక్చర్ యొక్క విశ్లేషణ
జనాభా మధ్య మరియు లోపల జన్యు వైవిధ్యం యొక్క క్రమానుగత విభజన AMOVA ద్వారా గణించబడింది. ఫలితాలు జనాభాలో (87%) జన్యు వైవిధ్యం యొక్క గణనీయమైన భాగాన్ని హైలైట్ చేశాయి. జనాభాలో వైవిధ్యం, 13%, చాలా ముఖ్యమైనది (P < 0.001) (టేబుల్ 3). 0.002 (ARO2/ARO10) నుండి 0.468 (ARO7/TRO2) వరకు ఉన్న రైట్ యొక్క Fst స్థిరీకరణ సూచిక యొక్క సారూప్యమైన Fpt పరామితి యొక్క జత వైపు విలువలు ముఖ్యమైనవి (P <0.05), తొమ్మిది జంటగా పోలికలు (సప్లిమెంటరీ టేబుల్ S3) మినహా.
పట్టిక 11. 320 జనాభా నుండి 16 జన్యురూపాల పరమాణు వైవిధ్యం యొక్క విశ్లేషణ అల్లియం సెపా L.
మూల | df | చతురస్రాల మొత్తం | వ్యత్యాస అంచనా | వ్యత్యాసం (%) | Fpt | P |
జనాభా మధ్య | 15 | 458.63 | 1.16 | 13% | ||
జనాభా లోపల | 304 | 2272.99 | 7.50 | 87% | 0.134 | 0.001 |
మొత్తం | 319 | 2731.62 | 8.66 |
లో జన్యు నిర్మాణం యొక్క పరిశోధన ఎ. సెపా ఈ అధ్యయనంలో సేకరణ జన్యురూపం సాఫ్ట్వేర్ స్ట్రక్చర్లో అమలు చేయబడిన అడ్మిక్చర్ మోడల్-ఆధారిత క్లస్టరింగ్ విశ్లేషణ ద్వారా నిర్వహించబడింది. Evanno AK పద్ధతి రెండు సమూహాలలో (K = 2) ఉపవిభజనను సూచించింది, ఇది మా కోసం అత్యంత సమాచారంగా ఉంది డేటాసెట్,వ తోe తరువాత అత్యధిక PEఎకె వద్ద కె = 5 (సప్లిమెంటైవ్ ర్గురే ఎస్ 1). ఒక K కోసం = 2, ahpopulations wగాడిదigned o కుnమరియుf రెండు సమూహాలు తో ఒక rnernbertoip గుణకం (q) > 0.7. లుగాhoప్రవేశించింది ఆకృతి 2a, మొదటి క్లస్టర్ (S1 పేరు పెట్టబడింది) MCO మరియు అన్ని ARO పాపులేషన్లను కలిగి ఉంది, అయితే S2 క్లస్టర్ రెండు TRO జనాభాను సమూహం చేసింది. K = 5 వద్ద, డేటాసెట్ యొక్క లోతైన వివరణను అందిస్తుంది (మూర్తి 2b), 75% ప్రవేశాలు ఐదు క్లస్టర్లలో ఒకదానికి కేటాయించబడ్డాయి. ARO (S1) మరియు TRO (S2) మధ్య విభజన నిర్ధారించబడింది, అయినప్పటికీ కొన్ని ARO జనాభాలు కలపబడ్డాయి (q <0.7) లేదా రెండు కొత్త క్లస్టర్లలో S3 మరియు S4 (ARO7 మరియు ARO12, వరుసగా) విడివిడిగా సమూహం చేయబడ్డాయి. ఆసక్తికరంగా, MCO వాణిజ్య రకం అపులియన్ ఎర్ర ఉల్లిపాయ నుండి వేరు చేయబడిన ఒక ప్రత్యేక క్లస్టర్ (S5)ను ఏర్పాటు చేసింది.
జనాభా మధ్య జన్యు సంబంధాలు
SSR పాలిమార్ఫిజం జన్యు వైవిధ్యం యొక్క డెండ్రోగ్రామ్ను గీయడానికి అనుమతించబడింది మరియు ఫైలోజెనెటిక్ విశ్లేషణ ఫలితాలు చిత్రంలో చూపబడ్డాయి 3a. ఇక్కడ, జెర్మ్ప్లాజమ్ సేకరణ బూట్స్ట్రాప్ విలువలచే బలంగా మద్దతు ఇవ్వబడిన ఐదు సమూహాలలో విభజించబడింది. ARO7 మరియు ARO12 జనాభా వెంటనే మిగిలిన జనాభా నుండి వేరు చేయబడింది మరియు రెండు విభిన్న సమూహాలను ఏర్పాటు చేసింది. మూడవ క్లస్టర్లో TRO యొక్క రెండు వాణిజ్య జనాభా ఉంది, అదే సమయంలో నాల్గవ నోడ్ MCOని పదకొండు ARO జనాభా నుండి విభజించింది. ప్రిన్సిపల్ కోఆర్డినేట్ అనాలిసిస్ (PCoA) (మూర్తి) ద్వారా జనాభా మధ్య ఏర్పడే జన్యు సంబంధం మరింత పరిశోధించబడింది. 3b) మునుపు హైలైట్ చేసినట్లుగా, ARO జనాభాలు PcoA ప్లాట్లో వివిక్త స్థానాల్లో కనిపించిన ARO12 మరియు ARO7 మినహా గట్టిగా సమూహం చేయబడ్డాయి. ప్లాట్ యొక్క దిగువ-కుడి ప్యానెల్లో రెండు TROలు మరియు MCO పాపులేషన్లు చెల్లాచెదురుగా ఉన్నాయి.
Figure 3. 16లో జన్యు వైవిధ్యం ఎ. సెపా వారి SSR ప్రొఫైల్ ఆధారంగా ఈ అధ్యయనంలో వర్గీకరించబడిన జనాభా. (a) జన్యు దూరం యొక్క UPGMA డెండ్రోగ్రామ్. బూట్స్ట్రాప్ మద్దతు విలువలు >50 సంబంధిత నోడ్ల పైన సూచించబడ్డాయి; (b) ప్రధాన భాగం విశ్లేషణ (PCoA). ఎరుపు రంగులో సర్కిల్ చేయబడిన క్లస్టర్ ఫైలోజెనెటిక్ విశ్లేషణ ద్వారా రూపొందించబడిన సమూహంతో పూర్తిగా సరిపోలింది మరియు 11 ARO ప్రవేశాల ద్వారా ఏర్పడింది.
చర్చా
దక్షిణ ఇటలీలో సాంప్రదాయకంగా సాగు చేయబడిన పెద్ద మొత్తంలో వ్యవసాయ-జీవవైవిధ్యంలో, ఉల్లిపాయ ల్యాండ్రేస్లు సముచిత ఉత్పత్తులను సూచిస్తాయి, వీటిని జన్యు కోత మరియు ఆధునిక సాగుల ద్వారా భర్తీ చేసే ప్రమాదం నుండి సంరక్షించాల్సిన అవసరం ఉంది. అపులియా ప్రాంతం యొక్క జన్యు వనరులను సేకరించడం, వర్గీకరించడం, ప్రోత్సహించడం మరియు రక్షించడం లక్ష్యంగా ప్రాంతీయ ప్రాజెక్ట్ బయోడైవర్ఎస్ఓ ఫ్రేమ్వర్క్లో, స్థానిక వారసత్వంతో బలంగా అనుసంధానించబడి ఉంది, మేము ARO ల్యాండ్రేస్లోని 13 జనాభాతో కూడిన విత్తన సేకరణను ఏర్పాటు చేసాము. మేము DNA పాలిమార్ఫిజమ్స్ మరియు రెండు జీవరసాయన పారామితులు, కరిగే ఘన మరియు పైరువిక్ యాసిడ్ కంటెంట్ల పరంగా ARO వైవిధ్యం యొక్క మొదటి అంచనాను నివేదించాము, రుచి లక్షణాలు మరియు తాజా వండని ఉత్పత్తుల అంగీకారానికి సంబంధించిన ప్రాముఖ్యత. అదనంగా, ARO ల్యాండ్రేస్లోని డేటాను రెండు ఇతర వర్ణద్రవ్యం కలిగిన ఉల్లిపాయ ల్యాండ్రేస్లపై సేకరించిన వాటితో పోల్చారు, దానితో ఇది తరచుగా తప్పుగా భావించబడుతుంది.
జీవరసాయన విశ్లేషణలు తీపి ఉల్లిపాయ పరిశ్రమ మార్గదర్శకాల ప్రకారం, అధిక కరిగే ఘన కంటెంట్ మరియు మధ్యస్థ తీక్షణతకు సంబంధించిన 13 ARO జనాభా యొక్క తీపిని హైలైట్ చేశాయి. [31]. ARO బల్బులు TRO మరియు MCO ల్యాండ్రేస్ల కంటే తియ్యగా ఉన్నాయి మరియు కొంచెం ఎక్కువ తీక్షణతను ప్రదర్శించాయి. ఏది ఏమయినప్పటికీ, ఉల్లిపాయలలో తీపి అనేది చక్కెర కంటెంట్ మరియు ఉధృతత మధ్య సమతుల్యత కారణంగా ఉంటుంది, కాబట్టి ఈ క్యారెక్టరైజేషన్ విలువ యొక్క జన్యురూపాల ఎంపికకు మద్దతు ఇవ్వడానికి ఉపయోగపడుతుంది, సాధారణంగా రైతులు పదనిర్మాణం ఆధారంగా మాత్రమే నిర్వహిస్తారు.
అక్వావివా డెల్లె ఫోంటి పట్టణం వంటి ఇరుకైన పెరుగుతున్న ప్రాంతంలో సేకరించబడినప్పటికీ, జన్యురూపాలను వివక్ష చూపడానికి SSR గుర్తులు ఒక ఉపయోగకరమైన సాధనంగా నిర్ధారించబడ్డాయి. ఎంచుకున్న మార్కర్లు గతంలో నివేదించిన మార్కర్ల కంటే ఎక్కువ సంఖ్యలో యుగ్మ వికల్పాలను ప్రదర్శించాయి [43] మరియు [44], కానీ నివేదించిన మార్కర్ల కంటే తక్కువ [45]. అంతేకాకుండా, మా గుర్తుల సెట్లో 50% 0.5 కంటే ఎక్కువ PIC ఇండెక్స్ విలువలను చూపించాయి, ఇది సూచించిన విధంగా సేకరణలోని జనాభాను వివక్ష చూపడానికి తగినదని రుజువు చేసింది [46]. జనాభాలోని వైవిధ్యం యొక్క అంచనా హో మరియు హీల మధ్య సారూప్య విలువలను వెల్లడించింది, ఫలితంగా తక్కువ Fis విలువలు. యొక్క అవుట్-క్రాసింగ్ స్వభావంతో ఇది ఏకీభవిస్తుంది ఎ. సెపా, ఇది సంతానోత్పత్తి మాంద్యంతో తీవ్రంగా బాధపడుతుంది [47]. మొత్తం Fis ఈ అధ్యయనంలో పరిగణించబడిన ఉల్లిపాయ జనాభాలో లెక్కించబడిన విలువ (0.054) గతంలో నివేదించిన దాని కంటే తక్కువగా ఉంది [45] (0.22) మరియు కనుగొన్న దానికి దాదాపు సమానంగా ఉంటుంది [31] (0.08) మరియు [48] (0.00) వరుసగా వాయువ్య స్పెయిన్ మరియు నైజర్ నుండి ఉల్లిపాయ ల్యాండ్రేస్లలో జన్యు వైవిధ్యాన్ని అంచనా వేశారు. ARO జనాభాలో గుర్తించదగిన స్థాయి హెటెరోజైగోసిటీ అనేక ఉద్యాన జాతులకు అపులియా ఒక వైవిధ్య కేంద్రాన్ని సూచిస్తుందనే భావనను బలపరుస్తుంది [32, 42, 49-51].
ఈ అధ్యయనంలో సేకరించిన జన్యురూపంలో చాలా పరమాణు వైవిధ్యం జనాభాలో ఉందని AMOVA హైలైట్ చేసింది. అయినప్పటికీ, జనాభాలో ముఖ్యమైన జన్యు భేదం (FPT విలువలు) జన్యు స్తరీకరణ సంభవించినట్లు వెల్లడించింది. వాస్తవానికి, మా ఫలితాలు చాలా ARO జనాభాలో జన్యు ఏకరూపత ఉనికిని సూచించినప్పటికీ, బాగా నిర్వచించబడిన క్లస్టర్ను ఏర్పరుస్తాయి, ARO7 మరియు ARO12 జనాభా స్పష్టంగా విభిన్నమైన జన్యు ప్రొఫైల్ను ప్రదర్శించాయి. జనాభాను సేకరించిన ఇద్దరు రైతులు ఉపయోగించిన విత్తనాల యొక్క భిన్నమైన మూలం కారణంగా ఈ ఫలితం ఉండవచ్చు. అంతేకాకుండా, పొందిన ఫలితాల ఆధారంగా, ARO ల్యాండ్రేస్ TRO మరియు MCO ల్యాండ్రేస్ల నుండి జన్యు స్థాయిలో స్పష్టంగా విభిన్నంగా పరిగణించబడుతుంది. ఇటీవలి అధ్యయనంలో, [29] "అక్వావివా," "ట్రోపియా," మరియు "మోంటోరో"తో సహా అనేక ఇటాలియన్ ఉల్లిపాయ ల్యాండ్రేస్ల జన్యు వైవిధ్యాన్ని అంచనా వేసింది. విస్తృత ఉల్లిపాయ సేకరణ యొక్క జన్యు వైవిధ్యాన్ని అంచనా వేయడానికి రచయితలు SNP గుర్తులను ఉపయోగించినప్పటికీ, జన్యురూపం "ట్రోపియా" మరియు "మోంటోరో" ఉల్లిపాయల నుండి "ఆక్వావివా"ని వివక్ష చూపలేకపోయింది. బహుశా, ఈ వైరుధ్యం తక్కువ సగటు PIC విలువ (0.292) కనుగొనబడి ఉండవచ్చు, ఇది క్లెయిమ్ చేసిన విధంగా విశ్లేషణలో ఉన్న స్థానం యొక్క నిరాడంబరమైన సాధారణ సమాచారాన్ని సూచిస్తుంది [29]. ఇంకా, వారి ఇటాలియన్ క్లస్టర్లో ఉప-నిర్మాణం ఉనికిని పరిశోధించడానికి, ఇటాలియన్ జన్యురూపాలను మిగిలిన సేకరణ నుండి విడిగా విశ్లేషించడం మంచిది. బహుశా ఇది భౌగోళిక స్తరీకరణ లేదా అనుభావిక ఎంపికలో ఉన్న లక్షణాలతో అనుసంధానించబడిన జన్యు వైవిధ్యం యొక్క నమూనాను దృశ్యమానం చేయడానికి అనుమతించి ఉండవచ్చు.
ముగింపులో, ప్రస్తుత అధ్యయనం స్థానిక సాంస్కృతిక వారసత్వం మరియు రైతులకు ఆర్థిక ప్రాముఖ్యతతో అనుబంధించబడిన ఉల్లిపాయ ల్యాండ్రేస్పై సమగ్ర నివేదికను సూచిస్తుంది. కొన్ని మినహాయింపులతో, ARO బాగా నిర్వచించబడిన జన్యు కొలను ద్వారా వర్గీకరించబడిందని మా ఫలితాలు హైలైట్ చేస్తాయి, ఇది జన్యు కోత ప్రమాదం నుండి సంరక్షించబడటానికి అర్హమైనది. అందువల్ల, జన్యు వైవిధ్యం యొక్క ఈ విలువైన మూలం యొక్క ప్రతినిధి సేకరణను ఏర్పాటు చేయడం చాలా కీలకమైనది. చివరగా, ARO యొక్క జన్యు మరియు సమలక్షణ లక్షణం యూరోపియన్ యూనియన్ నుండి నాణ్యమైన మార్కులను పొందేందుకు ఉపయోగపడుతుంది.
సామాగ్రి మరియు పద్ధతులు
జెర్మ్ప్లాజమ్ కలెక్షన్, ప్లాంట్ మెటీరియల్ మరియు DNA వెలికితీత
ARO ల్యాండ్రేస్ యొక్క 13 జనాభా సమితి అపులియా రీజియన్ ప్రాజెక్ట్ (బయోడైవర్SO: https://www.biodiversitapuglia.it/), ఇటలీలోని బారీ ప్రావిన్స్లోని ఒక చిన్న అపులియన్ పట్టణమైన "అక్వావివా డెల్లె ఫోంటి"లో చేపట్టిన మిషన్ల శ్రేణి ద్వారా. ప్రతి ప్రవేశాల సేకరణ సైట్లు భౌగోళిక సమాచార వ్యవస్థ (GIS) ద్వారా మ్యాప్ చేయబడ్డాయి మరియు పట్టికలో నివేదించబడ్డాయి 4. అదనంగా, TRO ల్యాండ్రేస్ నుండి రెండు జనాభా మరియు MCO ల్యాండ్రేస్ నుండి ఒక జనాభా ప్రస్తుత అధ్యయనంలో చేర్చబడ్డాయి మరియు సూచనలుగా ఉపయోగించబడ్డాయి. బారీ విశ్వవిద్యాలయం (41° 1'22.08″ N, 16°54'25.95″ E) యొక్క ప్రయోగాత్మక వ్యవసాయ క్షేత్రం "P మార్టుచి" వద్ద అన్ని మొక్కల పదార్థాలను ఒకే పర్యావరణ పరిస్థితులలో క్రాస్ పరాగసంపర్కాన్ని నివారించడానికి రక్షణ పంజరం క్రింద పెంచారు. జనాభా మరియు బ్లోఫ్లైస్ ద్వారా ఇంట్రా-పాపులేషన్ పరాగసంపర్కానికి భరోసా (లూసిలియా సీజర్). బల్బ్ పరిమాణం మరియు ఆకారం మరియు చర్మం మరియు మాంసం రంగు (టేబుల్ S16)కి సంబంధించిన లక్షణాల కోసం 1 జనాభా వర్గీకరించబడింది. అదనంగా, చేతితో పట్టుకున్న రిఫ్రాక్టోమీటర్ను ఉపయోగించి ఘన కరిగే కంటెంట్ పరీక్ష నిర్వహించబడింది మరియు ఉల్లిపాయ రసం నమూనాలలో 2,4-డైనిట్రోఫెనిల్ హైడ్రాజైన్ (0.125%) జోడించడం ద్వారా ఘాటు కొలుస్తారు. v/v HCl యొక్క 2Nలో) మరియు నివేదించినట్లుగా, 420 nm వద్ద శోషణను మూల్యాంకనం చేస్తుంది [31]. ముఖ్యమైన వ్యత్యాసాల ఉనికిని గుర్తించడానికి డంకన్ యొక్క బహుళ-శ్రేణి పరీక్ష మరియు SNK పరీక్ష నిర్వహించబడ్డాయి.
పట్టిక 11. ఈ అధ్యయనంలో సేకరించిన మరియు జన్యురూపం పొందిన జనాభాల జాబితా. ప్రతి జనాభాకు, ఐడెంటిఫికేషన్ కోడ్, స్థానిక పేరు, GPS కోఆర్డినేట్ మరియు విత్తనాలను భద్రపరిచే జీన్ బ్యాంక్ నివేదించబడతాయి.
కోడ్ | పేరు | జిపిఎస్ కోఆర్డినేట్స్ | జీన్ బ్యాంక్ y |
ARO1 | సిపోల్లా రోస్సా డి అక్వావివా | 40°54’21.708″ N 16°49’1.631” E | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
ARO2 | సిపోల్లా రోస్సా డి అక్వావివా | 40°53’14.28″ N 16°48’56.879” E | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
ARO3 | సిపోల్లా రోస్సా డి అక్వావివా | 40°54’11.304″ N 16°49’13.079” E | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
ARO4 | సిపోల్లా రోస్సా డి అక్వావివా | 40°54’3.348″ N 16°40’27.011” E | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
ARO5 | సిపోల్లా రోస్సా డి అక్వావివా | 40°51’59.76″ N 16°53’0.527” E | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
ARO6 | సిపోల్లా రోస్సా డి అక్వావివా | 40°52’48.72″ N 16°49’43.247” E | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
ARO7 | సిపోల్లా రోస్సా డి అక్వావివా | 40°53’13.47″ N 16°50’23.783” E | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
ARO8 | సిపోల్లా రోస్సా డి అక్వావివా | 40°53’18.816″ N 16°49’33.888” E | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
ARO9 | సిపోల్లా రోస్సా డి అక్వావివా | 40°54'51.372″ N 16°49'3.504" E | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
ARO10 | సిపోల్లా రోస్సా డి అక్వావివా | 40°54’1.188″ N 16°49’24.311” E | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
ARO11 | సిపోల్లా రోస్సా డి అక్వావివా | 40°52'49.8″ N 16°49'48.575" E | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
ARO12 | సిపోల్లా రోస్సా డి అక్వావివా | 40°52’38.892″ N 16°49’28.379” E | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
ARO13 | సిపోల్లా రోస్సా డి అక్వావివా | 40°53’21.768″ N 16°49’29.711” E | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
TRO1 | సిపోల్లా రోస్సా లుంగా డి ట్రోపియా | - | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
TRO2 | సిపోల్లా రోస్సా టోండా డి ట్రోపియా | - | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
MCO | సిపోల్లా రమటా డి మోంటోరో | - | డి.ఎస్.ఎస్.పి.ఎ |
y Di.SSPA, డిపార్ట్మెంట్ ఆఫ్ సాయిల్, ప్లాంట్ అండ్ ఫుడ్ సైన్సెస్, యూనివర్సిటీ ఆఫ్ బారీ. |
ప్రతి జనాభాకు 20 జన్యురూపాల లీఫ్ మెటీరియల్ నమూనా మరియు ఉపయోగం వరకు -80 °C వద్ద నిల్వ చేయబడింది. పాలీసాకరైడ్-రిచ్ జాతుల కోసం, వంటి ఎ. సెపా, మంచి-నాణ్యత DNA పొందేందుకు పాలీశాకరైడ్ను తొలగించే మొదటి దశలు చాలా అవసరం, కాబట్టి STE బఫర్లో ప్రారంభ వాష్లు (0.25 M సుక్రోజ్, 0.03 M ట్రిస్, 0.05 M EDTA) వివరించిన విధంగా నిర్వహించబడ్డాయి. [52]. CTAB పద్ధతిని అనుసరించి మొత్తం DNA సంగ్రహించబడింది [53] చివరకు నానో డ్రాప్ 2000 UV-vis స్పెక్ట్రోఫోటోమీటర్ (థర్మోసైంటిఫిక్, వాల్తామ్, MA, USA) మరియు 0.8% అగరోస్ జెల్ ఎలెక్ట్రోఫోరేసిస్ ద్వారా నాణ్యత మరియు ఏకాగ్రత కోసం తనిఖీ చేయబడింది.
SSR విశ్లేషణ
16 EST-SSR ప్రైమర్ కాంబినేషన్లను అభివృద్ధి చేసింది [54] మరియు గతంలో జన్యు వైవిధ్య అధ్యయనాలలో పరీక్షించబడింది [43] మరియు [44] మరియు 21 జెనోమిక్ SSR [45-55] వాటి అనుకూలతను అంచనా వేయడానికి పరీక్షించబడ్డాయి (సప్లిమెంటరీ టేబుల్ S4). ప్రతి ఫార్వర్డ్ SSR ప్రైమర్కు M13 టెయిల్ జోడించబడే ఎకనామిక్ ఫ్లోరోసెంట్ ట్యాగింగ్ పద్ధతిని ఉపయోగించి జన్యురూపం ప్రదర్శించబడింది. [56]. PCR మిశ్రమాలు 20 gL ప్రతిచర్యలో తయారు చేయబడ్డాయి: మొత్తం DNAలో 50 ng, 0.2 mM dNTP మిక్స్, 1X PCR రియాక్షన్ బఫర్, 0.8 U డ్రీమ్టాక్ DNA పాలిమరేస్ (థర్మో సైంటిఫిక్, వాల్తామ్, MA, USA), 0.16 gM రివర్స్ ప్రైమర్ , 0.032 gM ఫార్వర్డ్ ప్రైమర్ M13 సీక్వెన్స్ (5′-TGTAAAACGACGGCCAGT-3′)తో విస్తరించబడింది మరియు FAM లేదా NED ఫ్లోరోసెంట్ డైస్ (సిగ్మా-ఆల్డ్రిచ్, MO)తో లేబుల్ చేయబడిన యూనివర్సల్ M0.08 ప్రైమర్ యొక్క 13 gM. PCR ప్రతిచర్యలు సింప్లిఆంప్ (అప్లైడ్ బయోసిస్టమ్స్, CA, USA) థర్మోసైక్లర్లో మెజారిటీ ప్రైమర్ జతలకు క్రింది షరతులతో నిర్వహించబడ్డాయి: 94 నిమిషాలకు 5 °C, 40 సెకన్లకు 94 °C వద్ద 30 చక్రాలు, 58 °C 45 సెకన్లకు 72 సె మరియు 45 °C మరియు 72 నిమిషాలకు 5 °C వద్ద చివరి పొడిగింపు. ACM446 మరియు ACM449 విషయానికొస్తే, టచ్డౌన్ PCR 60 చక్రాలపై 55 °C నుండి 10 °C వరకు, 30 °C వద్ద 55 చక్రాలు, 5 °C వద్ద 72 నిమిషాల చివరి పొడిగింపుతో వర్తించబడుతుంది. PCR ఉత్పత్తులు 96-బావి ప్లేట్లో లోడ్ చేయబడ్డాయి మరియు 14 gL Hi-Di Formamide (లైఫ్ టెక్నాలజీస్, కార్ల్స్బాడ్, CA, USA) మరియు 0.5 gL జీన్స్కాన్ 500 ROX సైజ్ స్టాండర్డ్ (లైఫ్ టెక్నాలజీస్, కార్ల్స్బాడ్, CA, USA)తో కలపబడ్డాయి. ABI PRISM 3100 అవంట్ జెనెటిక్ ఎనలైజర్ (లైఫ్ టెక్నాలజీస్, కార్ల్స్బాడ్, CA, USA) క్యాపిల్లరీ సీక్వెన్సింగ్ మెషిన్ ద్వారా యాంప్లికాన్లు పరిష్కరించబడ్డాయి, ఇక్కడ యుగ్మ వికల్పాలు సహ-ఆధిపత్యంగా స్కోర్ చేయబడ్డాయి మరియు జీన్మ్యాపర్ సాఫ్ట్వేర్ వెర్షన్ 3.7 ఉపయోగించి కేటాయించబడ్డాయి.
సాఫ్ట్వేర్ GenAlEx 6.5 [57] మరియు సెర్వస్ 3.0.7 [58] యుగ్మ వికల్పాల సంఖ్య (Na), ప్రభావవంతమైన యుగ్మ వికల్పాల సంఖ్య (Ne), గమనించిన హెటెరోజైగోసిటీ (Ho), ఊహించిన హెటెరోజైగోసిటీ (He), పాలిమార్ఫిక్ ఇన్ఫర్మేషన్ కంటెంట్ (PIC), షానన్ యొక్క సమాచార సూచిక (I) మరియు స్థిరీకరణ సూచిక (Fis) అంచనా వేయడానికి ఉపయోగించబడ్డాయి. ) ప్రతి SSR లోకస్ కోసం.
జన్యు వైవిధ్యం యొక్క అంచనా
ఉల్లిపాయల జనాభా మధ్య మరియు లోపల జన్యు వైవిధ్యం యొక్క క్రమానుగత విభజనను GenAlEx 6.5 అంచనా వేసింది. [57] ప్రాముఖ్యత కోసం పరీక్షించడానికి 999 బూట్స్ట్రాపింగ్తో మాలిక్యులర్ వేరియెన్స్ (AMOVA) విశ్లేషణ ద్వారా. అంతేకాకుండా, GenAlEx 6.5 సాఫ్ట్వేర్ అన్ని SSR స్థానాలపై Ho, He మరియు Fis సగటును గణించడం ద్వారా ప్రతి జనాభాలోని వైవిధ్యాన్ని అంచనా వేయడానికి ఉపయోగించబడింది.
స్ట్రక్చర్ v.2.3.4 సాఫ్ట్వేర్లో అమలు చేయబడిన బయేసియన్ మోడల్-ఆధారిత క్లస్టరింగ్ అల్గోరిథం ద్వారా జనాభా నిర్మాణం ఊహించబడింది [59]. డేటా సెట్ 1 నుండి 10 వరకు అనేక ఊహాజనిత క్లస్టర్లతో (K) అమలు చేయబడింది, ప్రతి K విలువకు పది స్వతంత్ర పరుగులను సెట్ చేస్తుంది. ప్రతి పరుగు కోసం, ఫలితాల స్థిరత్వాన్ని ధృవీకరించే లక్ష్యంతో, 100,000 ప్రారంభ బర్న్-ఇన్ పీరియడ్ మరియు 100,000 మార్కోవ్ చైన్ మోంటే కార్లో (MCMC) పునరావృత్తులు మిశ్రమ నమూనా మరియు జనాభాలో స్వతంత్ర యుగ్మ వికల్ప పౌనఃపున్యాల క్రింద ప్రదర్శించబడ్డాయి. వివరించిన AK పద్ధతిని అమలు చేయడం ద్వారా ఎక్కువగా K విలువ నిర్ణయించబడుతుంది [60], వెబ్ ఆధారిత ప్రోగ్రామ్ స్ట్రక్చర్ హార్వెస్టర్లో [61]. ఒక వ్యక్తి జనాభా దాని సభ్యత్వ గుణకం (q-విలువ) 0.7 కంటే ఎక్కువగా ఉన్నప్పుడు నిర్దిష్ట క్లస్టర్కు కేటాయించబడుతుంది, లేకుంటే అది మిశ్రమ పూర్వీకులుగా పరిగణించబడుతుంది.
Nei యొక్క జన్యు దూర మాతృక (సప్లిమెంటరీ టేబుల్ S5) ద్వారా వెల్లడించిన ప్రవేశాల మధ్య జన్యు సంబంధాల నమూనాలను దృశ్యమానం చేయడానికి ప్రిన్సిపల్ కోఆర్డినేట్ విశ్లేషణ జరిగింది. యుగ్మ వికల్ప పౌనఃపున్యాల ఆధారంగా, POPTREEW సాఫ్ట్వేర్లో అంకగణిత సగటు (UPGMA) క్లస్టర్ విశ్లేషణతో అన్వెయిటెడ్ పెయిర్ గ్రూప్ పద్ధతిని అమలు చేస్తూ జన్యు దూరం యొక్క డెండ్రోగ్రామ్ నిర్మించబడింది. [62]. క్రమానుగత క్లస్టరింగ్లో విశ్వాసాన్ని అంచనా వేయడానికి బూట్స్ట్రాపింగ్ వర్తించబడింది, డేటా సెట్ యొక్క 100 రీసాంప్లింగ్ను సెట్ చేస్తుంది. చివరగా, MEGA X సాఫ్ట్వేర్ [63] చెట్టు డ్రాయింగ్ సాఫ్ట్వేర్గా ఉపయోగించబడింది.
సప్లిమెంటరీ మెటీరియల్స్: కిందివి ఆన్లైన్లో అందుబాటులో ఉన్నాయి http://www.mdpi.com/2223-7747/9/2/260/s1. టేబుల్ S1: ARO, MCO మరియు TRO బల్బుల యొక్క పదనిర్మాణ లక్షణం. టేబుల్ S2: ARO ల్యాండ్రేస్లు మరియు TRO మరియు MCO ల్యాండ్రేస్ల కోసం హెటెరోజైగోసిటీ మరియు ఫిక్సేషన్ సూచికలు లెక్కించబడ్డాయి. టేబుల్ S3: Fpt పరామితి యొక్క జత వైపు విలువలు. టేబుల్ S4: అధ్యయనంలో ఉపయోగించిన SSRల జాబితా. టేబుల్ S5. Nei జన్యు దూరం యొక్క పెయిర్వైస్ పాపులేషన్ మ్యాట్రిక్స్. మూర్తి S1: Evanno యొక్క డెల్టా Kతో మారుతున్న K విలువల లైన్ చార్ట్.
రచయిత రచనలు: CL మరియు LR అధ్యయనాన్ని రూపొందించారు మరియు ప్రయోగాన్ని రూపొందించారు; CL మరియు PI పరమాణు మార్కర్ విశ్లేషణను నిర్వహించాయి; ARM మరియు VZ ఫీల్డ్ ట్రయల్స్ నిర్వహించాయి; RM, SP, GR మరియు CL డేటా విశ్లేషణలో పాల్గొన్నాయి; RM మరియు CL మాన్యుస్క్రిప్ట్ రాశారు. రచయితలందరూ మాన్యుస్క్రిప్ట్ యొక్క ప్రచురించబడిన సంస్కరణను చదివి, అంగీకరించారు.
నిధులు: ఈ పనికి ప్రాంతీయ అపులియన్ ప్రాజెక్ట్ “అపులియన్ కూరగాయల జాతుల జీవవైవిధ్యం”-ప్రోగ్రామా డి స్విలుప్పో రూరేల్ పర్ లా పుగ్లియా 2014-2020 ద్వారా నిధులు అందించబడ్డాయి. మిసురా 10-సొట్టోమిసుర 10.2; మంజూరు CUP H92C15000270002, ఇటలీ.
రసీదులు: ప్రయోగంలో ఉపయోగించిన మొక్కల పదార్థాలను అందించినందుకు "అజియెండా అగ్రికోలా ఇయనోన్ అన్నా" మరియు "అసోసియోజియోన్ ప్రొడట్టోరి డెల్లా వెరా సిపోల్లా రోస్సా డి అక్వావివా" కృతజ్ఞతలు.
ఆసక్తి కలహాలు: రచయితలు ఆసక్తి కలయికను ప్రకటించరు.
ప్రస్తావనలు
- 1. స్టెర్న్, WT అల్లియం యొక్క ఎన్ని జాతులు అంటారు? క్యూ మాగ్. 1992, 9,180-182. [CrossRef]
- 2. FAOSTAT. FAO స్టాటిస్టికల్ డేటాబేస్. ఆన్లైన్లో అందుబాటులో ఉంది: http://www.fao.org/2017 (8 జనవరి 2019న యాక్సెస్ చేయబడింది).
- 3. బ్లాక్, E. వెల్లుల్లి మరియు ఉల్లిపాయల రసాయన శాస్త్రం. సైన్స్. యామ్. 1985, 252,114-119. [CrossRef]
- 4. లీ, బి.; జంగ్, JH; కిమ్, HS ఎలుకలో యాంటీఆక్సిడెంట్ చర్యపై ఎర్ర ఉల్లిపాయల అంచనా. ఫుడ్ కెమ్. టాక్సికోల్. 2012, 50, 3912-3919. [CrossRef]
- 5. లీ, SM; మూన్, J.; చుంగ్, JH; చా, YJ; షిన్, ఎలుకలలో ధమనుల త్రాంబోసిస్పై క్వెర్సెటిన్-రిచ్ ఆనియన్ పీల్ ఎక్స్ట్రాక్ట్స్ యొక్క MJ ప్రభావం. ఫుడ్ కెమ్. టాక్సికోల్. 2013, 57, 99-105. [CrossRef] [పబ్మెడ్]
- 6. యోషినారి, ఓ.; షియోజిమా, వై.; ఇగరాషి, K. జుకర్ డయాబెటిక్ కొవ్వు ఎలుకలలో ఉల్లిపాయ సారం యొక్క స్థూలకాయ వ్యతిరేక ప్రభావాలు. పోషకాలు 2012, 4,1518-1526. [CrossRef]
- 7. ఆకాష్, MSH; రెహమాన్, కె.; చెన్, S. స్పైస్ ప్లాంట్ అల్లియం సెపా: టైప్ 2 డయాబెటిస్ మెల్లిటస్ చికిత్స కోసం డైటరీ సప్లిమెంట్. పోషణ 2014, 30,1128-1137. [CrossRef] [పబ్మెడ్]
- 8. వాంగ్, వై.; టియాన్, WX; ఉల్లిపాయ యొక్క Ma, XF నిరోధక ప్రభావాలు (అల్లియం సెపా L.) ఫ్యాటీ యాసిడ్ సింథేస్ను నిరోధించడం ద్వారా క్యాన్సర్ కణాలు మరియు అడిపోసైట్ల విస్తరణపై సారం. ఆసియా పాక్. J. క్యాన్సర్ మునుపటి. 2012,13, 5573-5579. [CrossRef] [పబ్మెడ్]
- 9. లై, WW; Hsu, SC; చూహ్, FS; చెన్, YY; యాంగ్, JS; లిన్, JP; లియన్, JC; సాయ్, CH; చుంగ్, JG Quercetin NF-kappaB మరియు మ్యాట్రిక్స్ మెటాలోప్రొటీనేస్-2/-9 సిగ్నలింగ్ మార్గాలను నిరోధించడం ద్వారా SAS మానవ నోటి క్యాన్సర్ కణాల వలస మరియు దాడిని నిరోధిస్తుంది. యాంటీకాన్సర్ రెస్. 2013, 33,1941-1950. [పబ్మెడ్]
- 10. నికాస్ట్రో, HL; రాస్, SA; మిల్నర్, JA వెల్లుల్లి మరియు ఉల్లిపాయలు: వాటి క్యాన్సర్ నివారణ లక్షణాలు. క్యాన్సర్ మునుపటి. Res. 2015, 8,181-189. [CrossRef]
- 11. ఫోర్టే, ఎల్.; టోరిసెల్లి, పి.; బోనిని, ఇ.; గజ్జానో, M.; రూబిని, కె.; ఫిని, M.; బిగి, A. క్వెర్సెటిన్-ఫంక్షనలైజ్డ్ హైడ్రాక్సీఅపటైట్ యొక్క యాంటీఆక్సిడెంట్ మరియు ఎముక మరమ్మత్తు లక్షణాలు: ఒక ఇన్ విట్రో ఆస్టియోబ్లాస్ట్-ఆస్టియోక్లాస్ట్-ఎండోథెలియల్ సెల్ కో-కల్చర్ స్టడీ. ఆక్టా బయోమేటర్. 2016, 32, 298-308. [CrossRef]
- 12. యమజాకి, Y.; ఇవాసాకి, కె.; మికామి, M.; Yagihashi, A. ఏడు అల్లియం కూరగాయలలో పదకొండు రుచి పూర్వగాములు, S-Alk(en)yl-L-cysteine ఉత్పన్నాలు పంపిణీ. ఫుడ్ సైన్స్. సాంకేతికత. Res. 2011, 17, 55-62. [CrossRef]
- 13. బ్లాక్, E. ది ఆర్గానోసల్ఫర్ కెమిస్ట్రీ ఆఫ్ ది జెనస్ అల్లియం-ఇంప్లికేషన్స్ ఫర్ ది ఆర్గానిక్ కెమిస్ట్రీ ఆఫ్ సల్ఫర్. అంజివ్. రసాయనం Int. Ed. ఆంగ్లం. 1992, 31,1135-1178. [CrossRef]
- 14. గ్రిఫిత్స్, జి.; ట్రూమాన్, ఎల్.; క్రౌథర్, టి.; థామస్, బి.; స్మిత్, బి. ఉల్లిపాయలు-ఆరోగ్యానికి ప్రపంచ ప్రయోజనం. ఫైటోథర్. Res. 2002,16, 603-615. [CrossRef]
- 15. ష్విమ్మర్, S.; వెస్టన్, WJ ఉల్లిలో పైరువిక్ యాసిడ్ యొక్క ఎంజైమాటిక్ డెవలప్మెంట్ తీక్షణత యొక్క కొలత. J. అగ్రిక్. ఆహార రసాయనం. 1961, 9, 301-304. [CrossRef]
- 16. కెట్టర్, క్యాట్; ఉల్లిపాయలలో రాండిల్, WM Pungency అంచనా. లో ప్రయోగశాల బోధన కోసం పరీక్షించిన అధ్యయనాలు; కర్చర్, SJ, Ed.; అసోసియేషన్ ఫర్ బయాలజీ లాబొరేటరీ ఎడ్యుకేషన్ (ABLE): న్యూయార్క్, NY, USA, 1998; వాల్యూమ్ 19, పేజీలు 177-196.
- 17. హానెల్ట్, పి వర్గీకరణ, పరిణామం మరియు చరిత్ర. లో ఉల్లిపాయలు మరియు అనుబంధ పంటలు, సం. I. బోటనీ, ఫిజియాలజీ మరియు జెనెటిక్స్; రాబినోవిచ్, HD, బ్రూస్టర్, JL, Eds.; CRC ప్రెస్: బోకా రాటన్, FL, USA, 1990; పేజీలు 1-26.
- 18. రాబినోవిచ్, HD; కుర్రా, ఎల్. అల్లియం క్రాప్ సైన్స్: రీసెంట్ అడ్వాన్సెస్; CABI పబ్లిషింగ్: వాలింగ్ఫోర్డ్, UK, 2002.
- 19. మల్లోర్, సి.; కారవేడో, M.; ఎస్టోపనన్, జి.; మల్లోర్, F. ఉల్లిపాయ యొక్క జన్యు వనరుల లక్షణము (అల్లియం సెపా L.) స్పానిష్ ద్వితీయ వైవిధ్య కేంద్రం నుండి. వ్యవధి. J. అగ్రిక్. Res. 2011, 9,144-155. [CrossRef]
- 20. ఫెరియోలి, ఎఫ్.; D'Antuono, ఇటలీ మరియు ఉక్రెయిన్ నుండి స్థానిక ఉల్లిపాయ మరియు షాలోట్ జెర్మ్ప్లాజంలో ఫినోలిక్స్ మరియు సిస్టీన్ సల్ఫాక్సైడ్ల యొక్క LF మూల్యాంకనం. జెనెట్. రిసోర్. క్రాప్ ఎవోల్. 2016, 63, 601-614. [CrossRef]
- 21. పెట్రోపౌలోస్, SA; ఫెర్నాండెజ్, ఎ.; బారోస్, ఎల్.; ఫెరీరా, ICFR; Ntatsi, G. గ్రీస్ నుండి ఒక ఉల్లిపాయ స్థానిక ల్యాండ్రేస్ అయిన 'వాటికియోటికో' యొక్క పదనిర్మాణ, పోషక మరియు రసాయన వివరణ. ఫుడ్ కెమ్. 2015,182,156-163. [CrossRef]
- 22. లిగూరి, ఎల్.; ఆదిలెట్టా, జి.; నజ్జారో, ఎఫ్.; ఫ్రాటియన్ని, ఎఫ్.; డి మాటియో, M.; ఆల్బనీస్, D. బయోకెమికల్, యాంటీఆక్సిడెంట్ లక్షణాలు మరియు మధ్యధరా ప్రాంతంలోని వివిధ ఉల్లిపాయ రకాల్లో యాంటీమైక్రోబయల్ చర్య. J. ఫుడ్ మీస్. పాత్ర. 2019,13,1232-1241. [CrossRef]
- 23. యూ, KS; పైక్, ఎల్.; క్రాస్బీ, కె.; జోన్స్, ఆర్.; లెస్కోవర్, D. సాగులు, పెరుగుదల వాతావరణం మరియు బల్బ్ పరిమాణాల కారణంగా ఉల్లిపాయ తీక్షణతలో తేడాలు. సైన్స్ హార్టిక్. 2006,110,144-149. [CrossRef]
- 24. బీస్క్, ఎన్.; పెర్నర్, హెచ్.; స్క్వార్జ్, డి.; జార్జ్, ఇ.; క్రో, LW; రోహ్న్, S. క్వెర్సెటిన్-3, 4′-O-డిగ్లూకోసైడ్, క్వెర్సెటిన్-4′-O-మోనోగ్లూకోసైడ్, మరియు క్వెర్సెటిన్ యొక్క వివిధ భాగాలలో ఉల్లిపాయ బల్బ్ (అల్లియం సెపా L.) జన్యురూపం ద్వారా ప్రభావితమవుతుంది. ఫుడ్ కెమ్. 2010,122, 566-571. [CrossRef]
- 25. కరుసో, జి.; కాంటి, S.; విల్లారి, జి.; బొరెల్లి, సి.; మెల్చియోన్నా, జి.; మినుటోలో, M.; రస్సో, జి.; అమాల్ఫిటానో, C. దిగుబడి, నాణ్యత మరియు ఉల్లిపాయ యొక్క యాంటీఆక్సిడెంట్ కంటెంట్పై మార్పిడి సమయం మరియు మొక్కల సాంద్రత యొక్క ప్రభావాలు (అల్లియం సెపా L.) దక్షిణ ఇటలీలో. సైన్స్ హార్టిక్. 2014,166,111-120. [CrossRef]
- 26. పెరెజ్-గ్రెగోరియో, MR; రెగ్యురో, J.; సిమల్-గందర, జె.; రోడ్రిగ్స్, AS; ఆల్మేడా, DPF యాంటీఆక్సిడెంట్ ఫ్లేవనాయిడ్ల మూలంగా ఉల్లిపాయల అదనపు-విలువను పెంచడం: ఒక క్లిష్టమైన సమీక్ష. Crit. రెవ్. ఫుడ్ సైన్స్. నటర్గిం. 2014, 54,1050-1062. [CrossRef] [పబ్మెడ్]
- 27. పోన్ల్, టి.; ష్వీగర్ట్, RM; కార్లే, R. ఉల్లిలో కరిగే కార్బోహైడ్రేట్లు మరియు ఘాటైన సూత్రాలపై సాగు పద్ధతి మరియు సాగు ఎంపిక ప్రభావం (అల్లియం సెపా ఎల్.). J. అగ్రిక్. ఆహార రసాయనం. 2018, 66,12827-12835. [CrossRef] [పబ్మెడ్]
- 28. టెడెస్కో, I.; కార్బోన్, V.; స్పాగ్నులో, సి.; మినాసి, పి.; రస్సో, GL యొక్క రెండు దక్షిణ ఇటాలియన్ సాగుల నుండి ఫ్లేవనాయిడ్ల గుర్తింపు మరియు పరిమాణీకరణ అల్లియం సెపా L., ట్రోపియా (ఎర్ర ఉల్లిపాయ) మరియు మోంటోరో (రాగి ఉల్లిపాయ), మరియు ఆక్సీకరణ ఒత్తిడి నుండి మానవ ఎరిథ్రోసైట్లను రక్షించే వారి సామర్థ్యం. J. అగ్రిక్. ఆహార రసాయనం. 2015, 63, 5229-5238. [CrossRef]
- 29. విల్లానో, సి.; ఎస్పోసిటో, S.; కరుచి, ఎఫ్.; ఫ్రుస్సియాంట్, ఎల్.; కార్పుటో, డి.; అవర్సనో, R. ఉల్లిపాయలో అధిక-నిర్గమాంశ జన్యురూపం జన్యు వైవిధ్యం యొక్క నిర్మాణాన్ని మరియు పరమాణు పెంపకానికి ఉపయోగపడే సమాచార SNPలను వెల్లడిస్తుంది. మోల్. జాతి. 2019, 39, 5. [CrossRef]
- 30. మెర్కాటి, ఎఫ్.; లాంగో, సి.; పోమా, డి.; అరణితి, ఎఫ్.; లుపిని, ఎ.; మమ్మనో, MM; ఫియోర్, MC; అబెనవోలి, MR; Sunseri, F ఇటాలియన్ లాంగ్ షెల్ఫ్-లైఫ్ టొమాటో యొక్క జన్యు వైవిధ్యం (సోలనం లైకోపెర్సికం L.) SSR మరియు పదనిర్మాణ పండ్ల లక్షణాలను ఉపయోగించడం ద్వారా సేకరణ. జెనెట్. రిసోర్. క్రాప్ ఎవోల్. 2014, 62, 721-732. [CrossRef]
- 31. గొంజాలెజ్-పెరెజ్, S.; మల్లోర్, సి.; గార్సెస్-క్లావర్, ఎ.; మెరినో, ఎఫ్.; తబోద, ఎ.; రివెరా, ఎ.; పోమర్, ఎఫ్.; పెరోవిక్, డి.; సిల్వర్, C. ఉల్లిపాయల సేకరణలో జన్యు వైవిధ్యం మరియు నాణ్యత లక్షణాలను అన్వేషించడం (అల్లియం సెపా L.) వాయువ్య స్పెయిన్ నుండి ల్యాండ్రేస్లు. జన్యుశాస్త్రం 2015, 47, 885-900. [CrossRef]
- 32. లోట్టి, సి.; ఐయోవినో, పి.; సెంటోమని, I.; మార్కోట్రిజియానో, AR; ఫానెల్లి, వి.; మిమియోలా, జి.; సమ్మో, సి.; పవన్, ఎస్.; రికియార్డి, L. కాలే యొక్క జన్యు, జీవ-వ్యవసాయ మరియు పోషక లక్షణాలు (బ్రాసికా ఒలేరేసియా L. var ఎసిఫాలా) అపులియా, దక్షిణ ఇటలీలో వైవిధ్యం. వైవిధ్యం 2018,10, 25. [CrossRef]
- 33. బర్దారో, ఎన్.; మార్కోట్రిజియానో, AR; బ్రకుటో, వి.; మజ్జియో, ఆర్.; రికియార్డి, ఎఫ్.; లోట్టి, సి.; పవన్, ఎస్.; Ricciardi, L. నిరోధకత యొక్క జన్యు విశ్లేషణ Orobanche crenata (ఫోర్స్క్.) ఒక బఠానీలో (పిసుమ్ సాటివం L.) తక్కువ-స్ట్రిగోలాక్టోన్ లైన్. J. ప్లాంట్ పాథోల్. 2016, 98, 671-675.
- 34. వాకో, టి.; సుకజాకి, హెచ్.; యగుచి, ఎస్.; యమషిత, కె.; ఇటో, S.; షిగ్యో, M. ఉల్లిని బంచ్ చేయడంలో బోల్టింగ్ సమయం కోసం క్వాంటిటేటివ్ ట్రెయిట్ లొకి మ్యాపింగ్ (అలియం ఫిస్టులోసమ్ ఎల్.). యూఫైటికా 2016, 209, 537-546. [CrossRef]
- 35. ఢాకా, ఎన్.; ముఖోపాధ్యాయ, ఎ.; పరితోష్, కె.; గుప్తా, వి.; పెంటల్, డి.; ప్రధాన్, AK జెనిక్ SSRల గుర్తింపు మరియు SSR-ఆధారిత లింకేజ్ మ్యాప్ నిర్మాణం బ్రాసికా జున్సియా. యూఫైటికా 2017, 213, 15. [CrossRef]
- 36. ఆనందన్, ఎస్.; మోటే, SR; గోపాల్, J. SSR మార్కర్లను ఉపయోగించి ఉల్లిపాయ రకాల గుర్తింపు యొక్క మూల్యాంకనం. సీడ్ సైన్స్. సాంకేతికత. 2014, 42, 279-285. [CrossRef]
- 37. మిత్రోవా, కె.; స్వోబోడా, పి.; ఓవెస్నా, J. చెక్ రిపబ్లిక్ నుండి ఉల్లిపాయ సాగుల భేదం కోసం ఒక మార్కర్ సెట్ యొక్క ఎంపిక మరియు ధ్రువీకరణ. చెక్ J. జెనెట్. మొక్కల జాతి. 2015, 51, 62-67. [CrossRef]
- 38. డి రియెంజో, వి.; మియాజ్జీ, MM; ఫానెల్లి, వి.; సబెట్టా, W.; మోంటెముర్రో, C. అపులియన్ ఆలివ్ జెర్మ్ప్లాజమ్ జీవవైవిధ్యం యొక్క సంరక్షణ మరియు లక్షణం. ఆక్టా హార్టిక్. 2018,1199,1-6. [CrossRef]
- 39. మల్లోర్, సి.; ఆర్నెడో-ఆండ్రెస్, ఎ.; గార్సెస్-క్లావర్, A. స్పానిష్ జన్యు వైవిధ్యాన్ని అంచనా వేయడం అల్లియం సెపా మైక్రోసాటిలైట్ మార్కర్లను ఉపయోగించి ఉల్లిపాయల పెంపకం కోసం ల్యాండ్రేస్లు. సైన్స్ హార్టిక్. 2014,170,24-31. [CrossRef]
- 40. రివెరా, ఎ.; మల్లోర్, సి.; గార్సెస్-క్లావర్, ఎ.; గార్సియా-ఉల్లోవా, ఎ.; పోమర్, ఎఫ్.; సిల్వర్, C. ఉల్లిపాయలో జన్యు వైవిధ్యాన్ని అంచనా వేయడం (అల్లియం సెపా L.) వాయువ్య స్పెయిన్ నుండి ల్యాండ్రేస్లు మరియు యూరోపియన్ వైవిధ్యంతో పోల్చడం. NZJ పంట హార్టిక్. 2016, 44,103-120. [CrossRef]
- 41. డి గియోవన్నీ, సి.; పవన్, ఎస్.; టరాన్టో, ఎఫ్.; డి రియెంజో, వి.; మియాజ్జి, MM; మార్కోట్రిజియానో, AR; మాంగిని, జి.; మోంటెముర్రో, సి.; రికియార్డి, ఎల్.; లోట్టి, C. చిక్పా యొక్క గ్లోబల్ జెర్మ్ప్లాజమ్ సేకరణ యొక్క జన్యు వైవిధ్యం (సిసర్ అరిటినం L.) జన్యు కోత ప్రమాదంలో ఇటాలియన్ ప్రవేశాలతో సహా. ఫిజియోల్. మోల్. బయోల్. మొక్కలు 2017, 23,197-205. [CrossRef]
- 42. మజ్జియో, ఆర్.; మోర్గెస్, ఎ.; సొన్నాంటే, జి.; జులుగా, DL; పవన్, ఎస్.; రికియార్డి, ఎల్.; లోట్టి, C. బ్రోకలీ రాబ్లో జన్యు వైవిధ్యం (బ్రాసికా రాపా L. సబ్స్పి. సిల్వెస్ట్రిస్ (L.) Janch.) దక్షిణ ఇటలీ నుండి. సైన్స్ హార్టిక్. 2019, 253,140-146. [CrossRef]
- 43. జాక్సే, M.; మార్టిన్, W.; మెక్ కల్లమ్, జె.; హేవీ, M. ఉల్లి సాగు గుర్తింపు కోసం సింగిల్ న్యూక్లియోటైడ్ పాలిమార్ఫిజమ్స్, ఇండెల్స్ మరియు సింపుల్ సీక్వెన్స్ రిపీట్లు. జె. ఆమ్. Soc. హార్టిక్. సైన్స్ 2005,130, 912-917. [CrossRef]
- 44. మెక్ కల్లమ్, జె.; థామ్సన్, S.; పిథర్-జాయిస్, M.; కెనెల్, ఎఫ్. జెనెటిక్ డైవర్సిటీ అనాలిసిస్ మరియు ఎక్స్ప్రెస్డ్ సీక్వెన్స్ ట్యాగ్-సింపుల్ సీక్వెన్స్ రిపీట్ మార్కర్ల ఆధారంగా పండించిన బల్బ్ ఉల్లిపాయలో సింగిల్-న్యూక్లియోటైడ్ పాలిమార్ఫిజం మార్కర్ డెవలప్మెంట్. జె. ఆమ్. Soc. హార్టిక్. సైన్స్ 2008,133, 810-818. [CrossRef]
- 45. బాల్డ్విన్, S.; పిథర్-జాయిస్, M.; రైట్, కె.; చెన్, ఎల్.; మెక్కలమ్, J. బల్బ్ ఆనియన్ లోపల మరియు వాటి మధ్య జన్యు వైవిధ్యాన్ని అంచనా వేయడానికి బలమైన జన్యుపరమైన సాధారణ శ్రేణి పునరావృత మార్కర్ల అభివృద్ధి (అల్లియం సెపా L.) జనాభా. మోల్. జాతి. 2012, 30,1401-1411. [CrossRef]
- 46. డివుడీ, JA; హనీకట్, RL; తెల్ల తోక జింకలో స్కో, LC మైక్రోసాటిలైట్ గుర్తులు. J. హిరెడ్. 1995, 86, 317-319. [CrossRef] [పబ్మెడ్]
- 47. ఖోడదాది, M.; హసన్పనా, D. ఇరానియన్ ఉల్లిపాయ (అల్లియం సెపా L.) సంతానోత్పత్తి మాంద్యంకు సాగు ప్రతిస్పందనలు. వరల్డ్ యాప్. సైన్స్ జె. 2010,11, 426-428.
- 48. అబ్దు, ఆర్.; బకాస్సో, వై.; సాదౌ, M.; బౌడోయిన్, JP; హార్డీ, OJ నైజర్ ఉల్లిపాయల జన్యు వైవిధ్యం (అల్లియం సెపా L.) సాధారణ సీక్వెన్స్ రిపీట్ మార్కర్స్ (SSR) ద్వారా అంచనా వేయబడింది. ఆక్టా హార్టిక్. 2016,1143, 77-90. [CrossRef]
- 49. పవన్, ఎస్.; లోట్టి, సి.; మార్కోట్రిజియానో, AR; మజ్జియో, ఆర్.; బర్దారో, ఎన్.; బ్రకుటో, వి.; రికియార్డి, ఎఫ్.; టరాన్టో, ఎఫ్.; డి'అగోస్టినో, ఎన్.; స్కియావుల్లి, ఎ.; ఎప్పటికి. జీనోమ్-వైడ్ మార్కర్ డిస్కవరీ మరియు జెనోటైపింగ్ ద్వారా వెల్లడయ్యే విధంగా పండించిన చిక్పాలో ఒక ప్రత్యేకమైన జన్యు సమూహం. ప్లాంట్ జీనోమ్ 2017, 2017,<span style="font-family: arial; ">10</span> [CrossRef]
- 50. పవన్, ఎస్.; మార్కోట్రిజియానో, AR; సియాని, ఇ.; మజ్జియో, ఆర్.; జోన్నో, వి.; రుగ్గిరి, వి.; లోట్టి, సి.; రికియార్డి, L. జీనోటైపింగ్-బై-సీక్వెన్సింగ్ ఆఫ్ ఎ మెలోన్ (కుకుమిస్ మెలో L.) వైవిధ్యం యొక్క ద్వితీయ కేంద్రం నుండి జెర్మ్ప్లాజమ్ సేకరణ వివిధ జన్యు కొలనుల జన్యు వైవిధ్యం మరియు జన్యుపరమైన లక్షణాలను హైలైట్ చేస్తుంది. BMC జీనోమ్. 2017, 18, 59. [CrossRef]
- 51. డి రియెంజో, వి.; సియోన్, S.; టరాన్టో, ఎఫ్.; డి'అగోస్టినో, ఎన్.; మోంటెముర్రో, సి.; ఫానెల్లి, వి.; సబెట్టా, W.; బౌచెఫ్ఫా, S.; తమెంజారి, ఎ.; పాస్క్వాలోన్, ఎ.; ఎప్పటికి. మధ్యధరా బేసిన్లోని ఆలివ్ జనాభాలో జన్యు ప్రవాహం. పీర్ జె. 2018, 6. [CrossRef]
- 52. షెపర్డ్, LD; మెక్లే, TG పాలిసాకరైడ్-రిచ్ ప్లాంట్ టిష్యూ నుండి DNA వేరుచేయడం కోసం రెండు మైక్రో-స్కేల్ ప్రోటోకాల్లు. J. ప్లాంట్ Res. 2011,124, 311-314. [CrossRef]
- 53. డోయల్, JJ; డోయల్, JL తాజా కణజాలం నుండి మొక్కల DNA యొక్క ఐసోలేషన్. ఫోకస్ 1990,12,13-14.
- 54. కుహ్ల్, JC; చెయుంగ్, ఎఫ్.; కియావోపింగ్, వై.; మార్టిన్, W.; జెవ్డీ, వై.; మెక్ కల్లమ్, జె.; కాటనాచ్, ఎ.; రూథర్ఫోర్డ్, పి.; సింక్, KC; జెండరెక్, M.; ఎప్పటికి. 11,008 ఆనియన్ ఎక్స్ప్రెస్డ్ సీక్వెన్స్ ట్యాగ్ల యొక్క ప్రత్యేకమైన సెట్ మోనోకోట్ ఆర్డర్ల ఆస్పరాగేల్స్ మరియు పోల్స్ మధ్య వ్యక్తీకరించబడిన సీక్వెన్స్ మరియు జెనోమిక్ తేడాలను వెల్లడిస్తుంది. ప్లాంట్ సెల్ 2004,16, 114-125. [CrossRef]
- 55. కిమ్, HJ; లీ, HR; హ్యూన్, JY; పాట, KH; కిమ్, KH; కిమ్, JE; హుర్, CG; హార్న్, SSR ఫైండర్ ఉపయోగించి ఉల్లిపాయ జన్యు స్వచ్ఛత పరీక్ష కోసం CH మార్కర్ అభివృద్ధి. కొరియన్ J. జాతి. సైన్స్ 2012, 44, 421-432. [CrossRef]
- 56. Schuelke, M. PCR శకలాలు ఫ్లోరోసెంట్ లేబులింగ్ కోసం ఒక ఆర్థిక పద్ధతి. నాట్. బయోటెక్నాల్. 2000, 18, 233-234. [CrossRef] [పబ్మెడ్]
- 57. పీకల్, ఆర్.; స్మౌస్, PE GenAlEx 6.5: Excelలో జన్యు విశ్లేషణ. బోధన మరియు పరిశోధన కోసం పాపులేషన్ జెనెటిక్ సాఫ్ట్వేర్: ఒక నవీకరణ. బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ 2012, 28, 2537-2539. [CrossRef] [పబ్మెడ్]
- 58. కాలినోవ్స్కీ, ST; టేపర్, ML; మార్షల్, TC కంప్యూటర్ ప్రోగ్రామ్ CERVUS జన్యురూప దోషాన్ని ఎలా భర్తీ చేస్తుందో సమీక్షించడం పితృత్వ కేటాయింపులో విజయాన్ని పెంచుతుంది. మోల్. ఎకోల్. 2007,16,1099-1106. [CrossRef]
- 59. ప్రిచర్డ్, JK; స్టీఫెన్స్, M.; రోసెన్బర్గ్, NA; డొన్నెల్లీ, పి. అసోసియేషన్ మ్యాపింగ్ ఇన్ స్ట్రక్చర్డ్ పాపులేషన్. అం. J. హమ్ జెనెట్. 2000, 67, 170-181. [CrossRef]
- 60. ఇవాన్నో, జి.; రెగ్నాట్, S.; గౌడెట్, J. సాఫ్ట్వేర్ స్ట్రక్చర్ని ఉపయోగిస్తున్న వ్యక్తుల క్లస్టర్ల సంఖ్యను గుర్తించడం: ఒక అనుకరణ అధ్యయనం. మోల్. ఎకోల్. 2005,14, 2611-2620. [CrossRef]
- 61. ఎర్ల్, డి.; VonHoldt, B. స్ట్రక్చర్ హార్వెస్టర్: స్ట్రక్చర్ అవుట్పుట్ను దృశ్యమానం చేయడానికి మరియు ఇవాన్నో పద్ధతిని అమలు చేయడానికి ఒక వెబ్సైట్ మరియు ప్రోగ్రామ్. పరిరక్షించు. జెనెట్. రిసోర్. 2011, 4. [CrossRef]
- 62. టకేజాకి, ఎన్.; నీ, M.; తమురా, కె. పాప్ట్రీవ్: అల్లెల్ ఫ్రీక్వెన్సీ డేటా నుండి పాపులేషన్ ట్రీలను నిర్మించడం మరియు కొన్ని ఇతర పరిమాణాలను గణించడం కోసం పాప్ట్రీ యొక్క వెబ్ వెర్షన్. మోల్. బయోల్. Evol. 2014, 31, 1622-1624. [CrossRef]
- 63. కుమార్, ఎస్.; స్టెచెర్, జి.; లి, M.; క్న్యాజ్, సి.; తమురా, K. MEGA X. కంప్యూటింగ్ ప్లాట్ఫారమ్లలో మాలిక్యులర్ ఎవల్యూషనరీ జెనెటిక్స్ అనాలిసిస్. మోల్. బయోల్. Evol. 2018, 35,1547-1549. [CrossRef]